Asp.Net kullanacaksanız sunucunuz kaçınılmaz olarak Windows olacaktır. Dolayısıyla karşınıza firmaların sunduğu -genelde- iki veritabanı çıkacaktır: MySQL ve MsSQL.

Yaptığınız projede maliyet öne çıkacaksa o halde MySQL ücretsiz olması açısından kaçınılmaz olacaktır. Asp.Net ve MySQL ile geliştirilmiş çok sayıda örnek proje başarıyla tamamlanmıştır o açıdan gözünüz arkada kalmasın.

MsSQL Server ise Microsoft'un ürünü olması ve .Net ile doğal kardeşliği yüzünden ayrı bir avantaj olacaktır. MsSQL Server tercihinizde sizin için versiyon önemli olacaktır. Bu aşamada da 2008 sürümü tercih etmek iyi olacaktır.

Tercih noktasında karar tamamen size ait ancak şunu göz ardı etmeyin. Siz .Net tabanlı geliştiricisiniz ve destek/örnek noktasında en kolay MsSQL Server kaynaklarına ulaşabilirsiniz. Eğer yabancı dil sorununuz yoksa o zaman MySQL desteğine ulaşmanız daha kolay olacaktır.