Aşağıdaki kodu dener misiniz?
sql kodunu da loop döngüsünün içine eklerseniz sorun kalmaz
tablo ilişkileri kesilip aşağıdaki kodu yazınca sorunsuz çalıştı

Dim MyFile As String

Dim txtDosyaAdi() As String

'On Error Resume Next



ReDim DirectoryListArray(1000)



MyFile = Dir$(CurrentProject.Path & "\Müşteriler\_Tarananlar\*.pdf")

Counter = 0

Do While MyFile <> ""

    DirectoryListArray(Counter) = MyFile

    MyFile = Dir$

    Counter = Counter + 1

Loop



For x = 0 To Counter - 1

xMyFile = DirectoryListArray(x)

txtDosyaAdi = Split(xMyFile, "_")



xKonum = CurrentProject.Path & "\Müşteriler\_Tarananlar\"



Xhedef = CurrentProject.Path & "\Müşteriler\" & txtDosyaAdi(0)

If Dir(Xhedef, vbDirectory) = "" Then MkDir Xhedef

Xhedef = Xhedef & "\" & Replace(txtDosyaAdi(3), ".pdf", "")

If Dir(Xhedef, vbDirectory) = "" Then MkDir Xhedef

Xhedef = Xhedef & "\" & txtDosyaAdi(1)

If Dir(Xhedef, vbDirectory) = "" Then MkDir Xhedef

Xhedef = Xhedef & "\" & txtDosyaAdi(2)

If Dir(Xhedef, vbDirectory) = "" Then MkDir Xhedef

Xhedef = Xhedef & "\"



Name xKonum & xMyFile As Xhedef & xMyFile



DoCmd.RunSQL "insert into 2_Dosya_Link_T (MUSTERI_ADI,DOSYA_LINK) values ('" & _

              txtDosyaAdi(0) & "', '#" & Xhedef & xMyFile & "#');"

Next